RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CDK4	P11802	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GRM3	Q14832	879 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	KY	Q8NBH2	561 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TTC1	Q99614	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	NRP1	O14786	923 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PCSK6	P29122	969 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	DAOA	P59103	153 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	BMP10	O95393	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	AHSG	P02765	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	HTR7	P34969	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	GJA5	P36382	358 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	CCR10	P46092	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ACADVL	P49748	655 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	RHD	Q02161	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	IHH	Q14623	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ARMCX2	Q7L311	632 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	FCRL5	Q96RD9	977 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KDM4B-208	ENST00000589104	ASB14	A6NK59	587 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PTGES	O14684	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	VTN	P04004	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MMP3	P08254	477 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NMBR	P28336	390 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PNPLA4	P41247	253 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	IRX4	P78413	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	USP51	Q70EK9	711 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		H0Y858	1186 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	AP3B1	O00203	1094 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MTSS1	O43312	755 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	EPHA3	P29320	983 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GRIA4	P48058	902 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KPNA7	A9QM74	516 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		H3BNH8	94 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	NPR3	P17342	541 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC26A3	P40879	764 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SMO	Q99835	787 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	UTRN	P46939	3433 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TK2	O00142	265 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	F2	P00734	622 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C7	P10643	843 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.57	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms