RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SRC	P12931	536 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CYP11B1	P15538	503 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TGM2	P21980	687 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SOX5	P35711	763 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	STAT1	P42224	750 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NEK3	P51956	506 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	JAM2	P57087	298 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SGCG	Q13326	291 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PTK2B	Q14289	1009 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FZD2	Q14332	565 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NR0B2	Q15466	257 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ASIC2	Q16515	512 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ASB12	Q8WXK4	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	BMF	Q96LC9	184 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TBATA	Q96M53	351 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	MYOC	Q99972	504 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	STK33	Q9BYT3	514 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TRIM5	Q9C035	493 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FAM117A	Q9C073	453 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CEP44	Q9C0F1	390 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DDIT4	Q9NX09	232 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	RRN3	Q9NYV6	651 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SPAST	Q9UBP0	616 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	IL36A	Q9UHA7	158 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PLXNA2	O75051	1894 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CPED1	A4D0V7	1026 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TOR1B	O14657	336 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	FPGT	O14772	594 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TSPAN6	O43657	245 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PAGE1	O75459	146 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	GRAP2	O75791	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NEBL	O76041	1014 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	TNFSF15	O95150	251 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	MT-CO1	P00395	513 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	GYPC	P04921	128 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ITGB2	P05107	769 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	JUND	P17535	347 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CHRNB2	P17787	502 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ITGB7	P26010	798 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CASP14	P31944	242 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	L1CAM	P32004	1257 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NOS2	P35228	1153 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	KRT9	P35527	623 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PBX1	P40424	430 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CLDN2	P57739	230 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CENPC	Q03188	943 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PTK2	Q05397	1052 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PDCL	Q13371	301 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CDKN3	Q16667	212 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ARSI	Q5FYB1	569 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	NAA35	Q5VZE5	725 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	LRRC31	Q6UY01	552 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PLPP6	Q8IY26	295 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DEFB106A	Q8N104	65 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	KLK6	Q92876	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	RAB7B	Q96AH8	199 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ARRDC3	Q96B67	414 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	C1orf74	Q96LT6	269 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		6.98	□□□□□ -1.29
CS-233	ENST00000552688	BOC	Q9BWV1	1114 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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