RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331		B9A039	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NEURL1	O76050	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	BMP15	O95972	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CYP4B1	P13584	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ACP5	P13686	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	BDNF	P23560	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EFR3A	Q14156	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PIM3	Q86V86	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EME1	Q96AY2	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	COG5	Q9UP83	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NOS1	P29475	1434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0G2JK05	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SYN3	O14994	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CSF1	P09603	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RXRA	P19793	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CYP2J2	P51589	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GAD2	Q05329	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PLK5	Q496M5	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331		A0A1W2PPC1	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NDUFB8	O95169	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	METTL18	O95568	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LYL1	P12980	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HSD3B1	P14060	373 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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