RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511139.1

FAM172A-209, Transcript of family with sequence similarity 172 member A, human

TSL 5

Gene FAM172A, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM172A-209	ENST00000511139	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CLDN5	O00501	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CAPN9	O14815	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	VILL	O15195	856 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZW10	O43264	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GJB3	O75712	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EPHX1	P07099	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TPM2	P07951	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ABCB4	P21439	1286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C5AR1	P21730	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NFKBIA	P25963	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CCR1	P32246	355 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RXRG	P48443	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GCLM	P48507	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CCT8	P50990	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TPMT	P51580	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SUOX	P51687	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	UCN	P55089	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C21orf59	P57076	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KRT83	P78385	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZXDB	P98169	803 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EGR3	Q06889	387 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PEX6	Q13608	980 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GRM3	Q14832	879 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FXN	Q16595	210 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	WBP1	Q96G27	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	LHX5	Q9H2C1	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		A0A1B0GVM2	712 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		A0A1W2PPC4	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		O00370	1275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SHOX	O15266	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ACSL4	O60488	711 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TSPAN3	O60637	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DTNB	O60941	627 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HSF2BP	O75031	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CLDN11	O75508	207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SEMA4F	O95754	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	LTF	P02788	710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GP1BA	P07359	652 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ALPPL2	P10696	532 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CCDC130	P13994	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CD19	P15391	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GOT1	P17174	413 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ADORA2B	P29275	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HTR7	P34969	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PTGER3	P43115	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC6A11	P48066	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FMO5	P49326	533 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NDUFA8	P51970	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RAD23B	P54727	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CDK17	Q00537	523 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KDSR	Q06136	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68

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