RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	REPS1	Q96D71	796 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LRP6	O75581	1613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541		A6NCN8	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	INPPL1	O15357	1258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TNFSF14	O43557	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	DOK2	O60496	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	NFATC1	O95644	943 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	IRF1	P10914	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TFEB	P19484	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FMO4	P31512	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	IDUA	P35475	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CPOX	P36551	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	BLK	P51451	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CUL4A	Q13619	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GALNT3	Q14435	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GSTA3	Q16772	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RGS12	O14924	1447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PTP4A3	O75365	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	C1QL1	O75973	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SERPINC1	P01008	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	POU1F1	P28069	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	MLH1	P40692	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SOX2	P48431	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	HSF1	Q00613	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RHAG	Q02094	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	USP6NL	Q92738	828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541		Q9N2J8	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNF216-208	ENST00000479541	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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