RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 PCYT1AP49585 367 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 GORABQ5T7V8 394 aa3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 SETD9Q8NE22 299 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 LINS1Q8NG48 757 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 FEM1BQ9UK73 627 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 NCAPD3P42695 1498 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 OR6C68A6NDL8 312 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 B9A039 149 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 PPP1R3DO95685 299 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGAP8P85298 464 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 IL13RA2Q14627 380 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.54□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 TNIKQ9UKE5 1360 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 TOP2BQ02880 1626 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 STX16O14662 325 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 TNNT1P13805 278 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 NUDT6P53370 316 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC18A2Q05940 514 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 KIF5AQ12840 1032 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 DENND1BQ6P3S1 775 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 RUBCNQ92622 972 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 RNFT2Q96EX2 444 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 MSTO1Q9BUK6 570 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-210ENST00000479043 CHODLQ9H9P2 273 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-210ENST00000479043 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.53□□□□□ -1.84
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