RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 WDCPQ9H6R7 721 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CD248Q9HCU0 757 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GDAQ9Y2T3 454 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DGKBQ9Y6T7 804 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TCHHQ07283 1943 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MYH11P35749 1972 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ATMQ13315 3056 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 H7C4K7 107 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CYR61O00622 381 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PTGESO14684 152 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTS3O15072 1205 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GPR42O15529 346 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB43O43298 467 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TLR5O60602 858 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RECQL4O94761 1208 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 STBD1O95210 358 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EGFP01133 1207 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PLA2G2AP14555 144 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ENGP17813 658 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.632e-8■■□□□ 13.2
PTPRK-210ENST00000415055 GNA11P29992 359 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ADCY8P40145 1251 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LIFRP42702 1097 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BRCC3P46736 316 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 WNT3AP56704 352 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PTENP60484 403 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PPP2CBP62714 309 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PPP2CAP67775 309 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CD83Q01151 205 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PPP3CAQ08209 521 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DMC1Q14565 340 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PMS2CLQ68D20 193 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ANO7Q6IWH7 933 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PCGF5Q86SE9 256 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 Q8N1X5 172 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BICD2Q8TD16 824 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCT6BQ92526 530 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LENG9Q96B70 501 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GPR88Q9GZN0 384 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRPV4Q9HBA0 871 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GKN1Q9NS71 199 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TDP1Q9NUW8 608 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CEP72Q9P209 647 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 VWA7Q9Y334 891 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MYLKQ15746 1914 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NBASA2RRP1 2371 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MYH10P35580 1976 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PPL8 197 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PR48 441 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 J3QKU1 62 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PIP5K1CO60331 668 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FZD7O75084 574 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MOSPD3O75425 235 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PSMD10O75832 226 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 IL18RAPO95256 599 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GASTP01350 101 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BCKDHBP21953 392 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TNFSF4P23510 183 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ECHS1P30084 290 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CIITAP33076 1130 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAN1A1P33908 653 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ACVRL1P37023 503 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ALDH1A3P47895 512 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CLCNKBP51801 687 aa4.87□□□□□ -1.63
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