RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNMB4Q86W47 210 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DENND1CQ8IV53 801 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CPNE1Q99829 537 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NPHS2Q9NP85 383 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM51Q9NW97 253 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD8Q9NX08 183 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A0D9SEW6 157 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DRGXA6NNA5 263 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 AP3B1O00203 1094 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 COCHO43405 550 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSL4O60488 711 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ABLIM3O94929 683 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 UBOX5O94941 541 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CSPG5O95196 566 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 VAPBO95292 243 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 EFEMP2O95967 443 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PEX11BO96011 259 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 URODP06132 367 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RAG1P15918 1043 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SAT1P21673 171 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A4P31645 630 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CRHR1P34998 444 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNFP41002 786 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SCTRP47872 440 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS24P62847 133 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TMPRSS15P98073 1019 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DSG1Q02413 1049 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DSC2Q02487 901 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MPP3Q13368 585 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NAB1Q13506 487 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PCID2Q5JVF3 399 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TIFABQ6ZNK6 161 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DCLK2Q8N568 766 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FITM2Q8N6M3 262 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2A3Q93084 1043 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPON2Q9BUD6 331 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF38Q9H0F5 515 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FNIP2Q9P278 1114 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 YIPF1Q9Y548 306 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO16Q9Y6X6 1858 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf78A6NCI8 922 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN3O60637 253 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KLKB1P03952 638 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ADRA1AP35348 466 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC11A2P49281 568 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TWF1Q12792 350 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SERINC3Q13530 473 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 VEPH1Q14D04 833 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NR6A1Q15406 480 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CHI3L2Q15782 390 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CNGA3Q16281 694 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FYB2Q5VWT5 728 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IL31Q6EBC2 164 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RANBP10Q6VN20 620 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7D4Q8NG98 312 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PPM1EQ8WY54 764 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 E2F7Q96AV8 911 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF333Q96JL9 665 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2S1Q96SQ9 504 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms