RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 WWP1Q9H0M0 922 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEH1Q9H213 219 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 HEY2Q9UBP5 337 aa23.17■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 DSG1Q02413 1049 aa23.16■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 LAMB3Q13751 1172 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 VAPBO95292 243 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 EPOP01588 193 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 CPA3P15088 417 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 CD86P42081 329 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 KCNQ1P51787 676 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 KRT72Q14CN4 511 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF354CQ86Y25 554 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 LGI2Q8N0V4 545 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 TOP1MTQ969P6 601 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF558Q96NG5 402 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 KLHL5Q96PQ7 755 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 NACA2Q9H009 215 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD9-201ENST00000249499 PDFQ9HBH1 243 aa23.15■■□□□ 1.3
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HOXD9-201ENST00000249499 ZBTB16Q05516 673 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 ITKQ08881 620 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 GRM3Q14832 879 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 PEX13Q92968 403 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.14■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 SLC1A6P48664 564 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 C10orf107Q8IVU9 208 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.13■■□□□ 1.29
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HOXD9-201ENST00000249499 CLDN11O75508 207 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 RALBP11234 206 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 RPL17P18621 184 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 KCNA4P22459 653 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 ALDH1A3P47895 512 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 DSC2Q02487 901 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 SLC12A1Q13621 1099 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 PCSK7Q16549 785 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXD9-201ENST00000249499 CHST9Q7L1S5 443 aa23.13■■□□□ 1.29
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