RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF132P52740 706 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 NCKAP1LP55160 1127 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ERVFRD-1P60508 538 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CXADRP78310 365 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MYL7Q01449 175 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KIF19Q2TAC6 998 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 BROXQ5VW32 411 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FAM171BQ6P995 826 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SCN4BQ8IWT1 228 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CNTD1Q8N815 330 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 WDR48Q8TAF3 677 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ALG3Q92685 438 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FGF11Q92914 225 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF560Q96MR9 790 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ACOX2Q99424 681 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KCND2Q9NZV8 630 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 A0A1B0GVT2 93 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM24O15164 1050 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 HUS1O60921 280 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 REC8O95072 547 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LTFP02788 710 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GLI1P08151 1106 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PCSK1P29120 753 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LHX1P48742 406 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MAPKAPK2P49137 400 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TRIM29Q14134 588 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC142Q17RM4 750 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 INAVAQ3KP66 663 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FUT11Q495W5 492 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CCDC157Q569K6 752 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DCAF12L1Q5VU92 463 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FYB2Q5VWT5 728 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KRT79Q5XKE5 535 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RPTNQ6XPR3 784 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KCNK18Q7Z418 384 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ERICH1Q86X53 443 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM25Q86YD3 366 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 HIPK4Q8NE63 616 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 COG1Q8WTW3 980 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 IGSF8Q969P0 613 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GPR174Q9BXC1 333 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RAB34Q9BZG1 259 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 FTSJ1Q9UET6 329 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 RAD54BQ9Y620 910 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 KCNJ18B7U540 433 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PRRT4C9JH25 899 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SLC28A2O43868 658 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CACNG3O60359 315 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 DFNA5O60443 496 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CD40P25942 277 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ABCD1P33897 745 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ACTN2P35609 894 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TRAPPC10P48553 1259 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ACOT2P49753 483 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 CCT8P50990 548 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TPMTP51580 245 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 UCNP55089 124 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 STARD3Q14849 445 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 MCTP1Q6DN14 999 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00640-204ENST00000557295 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms