RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPMQ5VYY2 423 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 USP33Q8TEY7 942 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 IPPQ9Y573 584 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-202ENST00000417536 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA3BQ13214 749 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FLOT2Q14254 428 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf89Q6UX73 402 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC7Q7Z402 723 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINI1Q99574 410 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 IL22Q9GZX6 179 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GRID2O43424 1007 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 XPOTO43592 962 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO21O94952 628 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NPY2RP49146 381 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CHN2P52757 468 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF460Q14592 562 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB16A2A368 324 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L7P0C7H9 530 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM200BP0CF97 657 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM2Q14416 872 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SATL1Q86VE3 508 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 EDEM1Q92611 657 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR22Q99680 433 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MID2Q9UJV3 735 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NCAM2O15394 837 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX1O43933 1283 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PGM3O95394 542 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHA2P01877 340 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 THPOP40225 353 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TLR1Q15399 786 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CNDP1Q96KN2 507 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC9A7Q96T83 725 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BPTFQ12830 3046 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TSC2P49815 1807 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DAOAP59103 153 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SP3Q02447 781 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NTAN1Q96AB6 310 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 HDAC11Q96DB2 347 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD9Q96Q07 612 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNA1P02708 482 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 APOA4P06727 396 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNE1P15382 129 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH17Q12864 832 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TEKT5Q96M29 485 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LRGUKQ96M69 825 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CDYLQ9Y232 598 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CABYRO75952 493 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6B1O95007 311 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 AHSGP02765 367 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRB3P28472 473 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms