RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398529.7

RAB1A-201, Transcript of RAB1A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB1A, Length 1,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1A-201ENST00000398529 CPED1A4D0V7 1026 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CHRNA3P32297 505 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RPIAP49247 311 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SNX16P57768 344 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 LY6DQ14210 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ISXQ2M1V0 245 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ZNF284Q2VY69 593 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FBXL22Q6P050 247 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 Q6ZSR6 202 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ARL14Q8N4G2 192 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MED8Q96G25 268 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 WDR70Q9NW82 654 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MAST4O15021 2626 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.64□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 E5RJQ4 531 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 K7ESM1 405 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 THAP12O43422 761 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SLC28A2O43868 658 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CALCAP01258 141 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 GLI1P08151 1106 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ZNF75DP51815 510 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 TAS2R38P59533 333 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 NME3Q13232 169 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MEA1Q16626 185 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FIGNQ5HY92 759 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 TMEM110Q86TL2 294 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 VSTM4Q8IW00 320 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FEM1CQ96JP0 617 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 NOX5Q96PH1 765 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 STK33Q9BYT3 514 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FZD3Q9NPG1 666 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SATB2Q9UPW6 733 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 HSF2BPO75031 334 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 IGLV3-25P01717 112 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RHOCP08134 193 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CDH4P55283 916 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 JAM2P57087 298 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CLDN2P57739 230 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CENPCQ03188 943 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SGCGQ13326 291 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CDKN3Q16667 212 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 DEFB106AQ8N104 65 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 IL12RB2Q99665 862 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 HDAC8Q9BY41 377 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FAM117AQ9C073 453 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SIK2Q9H0K1 926 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 IL36AQ9UHA7 158 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.62□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 F8VZ95 297 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 FPGTO14772 594 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 NEBLO76041 1014 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 SRCP12931 536 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 MYF5P13349 255 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 GNA15P30679 374 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 USP8P40818 1118 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 RABIFP47224 123 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 CLCN6P51797 869 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 NR0B2Q15466 257 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 ARSIQ5FYB1 569 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 LRRC31Q6UY01 552 aa14.61□□□□□ -0.07
RAB1A-201ENST00000398529 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms