RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BBS2Q9BXC9 721 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CYLDQ9NQC7 956 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAP91O60641 907 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOAP61586 193 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC23Q5W5X9 447 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF280DQ6N043 979 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GANCQ8TET4 914 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BTBD9Q96Q07 612 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF19AQ9NV58 838 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CBX4O00257 560 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 POMCP01189 267 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MPSTP25325 297 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PRDX6P30041 224 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX6P35712 828 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MFSD10Q14728 455 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FZD1Q9UP38 647 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DERAQ9Y315 318 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SOAT1P35610 550 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NUMBP49757 651 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PGS1Q32NB8 556 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN9P43378 593 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 VGLL4Q14135 290 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf50Q9BV19 199 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DHRS12A0PJE2 317 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 H7C4K7 107 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HS6ST1O60243 411 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 VNN1O95497 513 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NAA20P61599 178 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TNK2Q07912 1038 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DUSP16Q9BY84 665 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MAF1Q9H063 256 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DYRK4Q9NR20 520 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KATNA1O75449 491 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC159P0C7I6 412 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 LIMK2P53671 638 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DSELQ8IZU8 1212 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF276Q8N554 614 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GAD1Q99259 594 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MPP6Q9NZW5 540 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NRCAMQ92823 1304 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ADRA1BP35368 520 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 DPYSQ14117 519 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 GPSM1Q86YR5 675 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SFRP1Q8N474 314 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ACTRT2Q8TDY3 377 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 APOL4Q9BPW4 351 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 HMG20AQ9NP66 347 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS28Q9UK41 221 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB26Q9ULW5 256 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS5O15539 181 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KPNA6O60684 536 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC7A2P52569 658 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 BFSP2Q13515 415 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 PGAM4Q8N0Y7 254 aa16.55■□□□□ 0.24
CTDSP2-201ENST00000398073 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms