RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ACSS2Q9NR19 701 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC39A10Q9ULF5 831 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 POMPQ9Y244 141 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SBF1O95248 1867 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 G3V2L1 256 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 DENRO43583 198 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM13O60858 407 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO21O94952 628 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 F2P00734 622 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 JCHAINP01591 159 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LPIN1Q14693 890 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC43Q8N309 656 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RIN3Q8TB24 985 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RNF34Q969K3 372 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MOCOSQ96EN8 888 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SENP8Q96LD8 212 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GBA3Q9H227 469 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 WDCPQ9H6R7 721 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 INIPQ9NRY2 104 aa13.39□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA8OA6NCC3 632 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 H3BSA7 217 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TIMM44O43615 452 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PEX1O43933 1283 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CRTAMO95727 393 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 COX4I1P13073 169 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 9.1
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEA12P43365 314 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CD97P48960 835 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NPY2RP49146 381 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GRB14Q14449 540 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 CNGA3Q16281 694 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 EPGNQ6UW88 154 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ACTRT2Q8TDY3 377 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 USP33Q8TEY7 942 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NTAN1Q96AB6 310 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SMOQ99835 787 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TASP1Q9H6P5 420 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TLK1Q9UKI8 766 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 RAD54BQ9Y620 910 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NUP205Q92621 2012 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP10A1A4S6 786 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MAGEB16A2A368 324 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PTGESO14684 152 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MTSS1O43312 755 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LTFP02788 710 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MYL3P08590 195 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ITGAXP20702 1163 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NMBRP28336 390 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PSEN2P49810 448 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 AIF1P55008 147 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 FAM35AQ86V20 835 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35B4Q969S0 331 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ISL2Q96A47 359 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 VPS39Q96JC1 886 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SCYL1Q96KG9 808 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TSNARE1Q96NA8 513 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 APBA2Q99767 749 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 COLEC11Q9BWP8 271 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 OR12D3Q9UGF7 316 aa13.38□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GTW7 788 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM114B3SHH9 223 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 NEMP1O14524 444 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 GABRDO14764 452 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB14O43829 449 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 LRPAP1P30533 357 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 HCAR3P49019 387 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PGGT1BP53609 377 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 KLF10Q13118 480 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 SEMA3BQ13214 749 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 PRPSAP1Q14558 356 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 C9orf131Q5VYM1 1079 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 KCTD11Q693B1 232 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 MAPK15Q8TD08 544 aa13.37□□□□□ -0.27
TMOD1-202ENST00000375175 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms