RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0A0MRY4 1105 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 OR6B1O95007 311 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CDK16Q00536 496 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA13Q96N96 652 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA2Q9UM82 520 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SESN1Q9Y6P5 492 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PEX11AO75192 247 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLURP2P0DP57 97 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 IZUMO1Q8IYV9 350 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF276Q8N554 614 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 BCL2L14Q9BZR8 327 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SATB2Q9UPW6 733 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD10O75832 226 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ME2P23368 584 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SVOPQ8N4V2 548 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 GPR156Q8NFN8 814 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 BTRCQ9Y297 605 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CATP04040 527 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PTSQ03393 145 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ACSL4O60488 711 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CABYRO75952 493 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 IFNGR2P38484 337 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 GPAT3Q53EU6 434 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SCIMPQ6UWF3 145 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 B4GALT5O43286 388 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 JAK1P23458 1154 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CASP7P55210 303 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1A4Q13733 1029 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM7Q19AV6 140 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 UNC93AQ86WB7 457 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FIBCD1Q8N539 461 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 NAT16Q8N8M0 369 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CHADO15335 359 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 GOT1P17174 413 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CDK7P50613 346 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CACNA2D1P54289 1103 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CAPSQ13938 189 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLITRK2Q9H156 845 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 DAPK2Q9UIK4 370 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CHKBQ9Y259 395 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf29Q8N999 325 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SNX6Q9UNH7 406 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FGRP09769 529 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ALADP13716 330 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PIGZQ86VD9 579 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 FERD3LQ96RJ6 166 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CDT1Q9H211 546 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RXRGP48443 463 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ASTN1O14525 1302 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ZMPSTE24O75844 475 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 BCL10O95999 233 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SKP1P63208 163 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SLC34A1Q06495 639 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RALGDSQ12967 914 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 STARD8Q92502 1023 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 GUCY1B2O75343 617 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 PIK3R1P27986 724 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 COPZ1P61923 177 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 SP3Q02447 781 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 CNGA2Q16280 664 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 ASB2Q96Q27 587 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRM-201ENST00000332175 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms