RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ILVBLA1L0T0 632 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 OIP5O43482 229 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNG3O60359 315 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 BANF1O75531 89 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KLKB1P03952 638 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF1P10914 325 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MYL4P12829 197 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NFKB1P19838 968 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXA9P31269 272 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCN4P51793 760 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R2AP63151 447 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A9P82251 487 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SERINC3Q13530 473 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TERF2Q15554 542 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 QPCTQ16769 361 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CASC4Q6P4E1 433 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RFWD3Q6PCD5 774 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GAREM2Q75VX8 874 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CNTD1Q8N815 330 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAB21L3Q8N8X9 362 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FBF1Q8TES7 1133 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 USP33Q8TEY7 942 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TLCD1Q96CP7 247 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HMCESQ96FZ2 354 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF599Q96NL3 588 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMYM5Q9UJ78 669 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CPQQ9Y646 472 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 COL4A6Q14031 1691 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LTBP2Q14767 1821 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVM2 712 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 F5H423 210 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GRM6O15303 877 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL16O15467 120 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 OLFM2O95897 454 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CKMP06732 381 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A4P31645 630 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GNA12Q03113 381 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ITKQ08881 620 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH17Q12864 832 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GPM6BQ13491 265 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MTM1Q13496 603 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF783Q6ZMS7 281 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR3DQ70Z44 454 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IGDCC3Q8IVU1 814 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP52Q8N1V2 620 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAML1Q92585 1016 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP36Q96G28 342 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SPON2Q9BUD6 331 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPS2Q9BXY5 557 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC3Q9BY71 257 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS45Q9NRW7 570 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SENP1Q9P0U3 644 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF212Q9UDV6 495 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TBK1Q9UHD2 729 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TTLL3Q9Y4R7 772 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRU2 124 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y626 953 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BNC9 293 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 J3KR12 359 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF197O14709 1029 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN3O60637 253 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF11O60813 436 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 POLBP06746 335 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CA3P07451 260 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 INHBAP08476 426 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOGP15173 224 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAM1P18669 254 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT15P19012 456 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CES1P23141 567 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB1P25685 340 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AVPR1AP37288 418 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms