RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 RDH11Q8TC12 318 aa24.29■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 RAET1EQ8TD07 263 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 FATE1Q969F0 183 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 HMCESQ96FZ2 354 aa24.29■■□□□ 1.48
TRIM54-201ENST00000296098 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.29■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa24.28■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 KDELC2Q7Z4H8 507 aa24.27■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.27■■□□□ 1.48
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TRIM54-201ENST00000296098 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.26■■□□□ 1.47
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TRIM54-201ENST00000296098 FBXO27Q8NI29 283 aa24.26■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 CDH19Q9H159 772 aa24.26■■□□□ 1.47
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.26■■□□□ 1.47
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