RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArsiQ32KI9 573 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem130Q6NXM3 419 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr798Q7TRH8 311 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr792Q7TRH9 311 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fads6Q80UG1 342 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q80Y73 168 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msantd1Q8BIL2 278 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8CCC3 530 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adprhl2Q8CG72 370 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps28Q9D1C8 221 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem114Q9D563 222 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Timp4Q9JHB3 224 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp3a41aQ9JMA7 504 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Coro1cQ9WUM4 474 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd320Q9Z1P5 260 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3173A6NAS3 172 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3020E9Q3J7 150 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr292F8VQ84 308 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pot1bH7BX60 640 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2897K7N6T7 172 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adcyap1r1P70205 496 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr1bP70700 1135 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hrh2P97292 397 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fscn2Q32M02 492 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema3cQ62181 751 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Catsper3Q80W99 395 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clic5Q8BXK9 251 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbpl6Q8BXR9 959 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3411Q8C7R2 150 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rftn2Q8CHX7 500 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gfm2Q8R2Q4 779 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mccc1Q99MR8 717 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slamf8Q9D3G2 278 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CdylQ9WTK2 593 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apobec2Q9WV35 224 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap4b1Q9WV76 738 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb12Q9Z150 459 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2b13A6H6J2 491 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdelc2G5E897 503 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd72P21855 354 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Htr2cP34968 459 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxb13P70321 286 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ZbbxQ0P5X5 716 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klhl14Q69ZK5 630 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cept1Q8BGS7 416 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gabra5Q8BHJ7 463 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssx2ipQ8VC66 615 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp566Q8VCI1 386 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HnmtQ91VF2 295 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anxa13Q99JG3 317 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PigxQ99LV7 254 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Syde1Q9DBZ9 737 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpm7Q923J1 1863 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wfdc16A2A5H4 111 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts14E9PX39 1209 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PdgfrbP05622 1098 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TxnP10639 105 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp5jP97450 108 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Treml2Q2LA85 329 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TchpQ3TVW5 497 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tpd52Q62393 224 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssx9Q6XAS3 170 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpina12Q7TMF5 413 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dus2Q9D7B1 493 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chit1Q9D7Q1 464 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifrd2Q9D8U0 441 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dpp7Q9ET22 506 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NmbrO54799 390 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r1O70410 912 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tial1P70318 392 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q32M26 199 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Has1Q61647 583 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prkaa2Q8BRK8 552 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx29Q9D3S3 818 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il18rapQ9Z2B1 614 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3264L7N2C5 238 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema3aO08665 772 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcar1Q61140 874 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprrQ62132 656 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhb17Q91VD8 799 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CenpsQ9D084 142 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P2yr13Q9D8I2 337 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx59Q9DBN9 619 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AadatQ9WVM8 425 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.5 ms