RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 LRIG2O94898 1065 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 METTL18O95568 372 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ITGB1P05556 798 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CREB1P16220 341 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 BDNFP23560 247 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PTPN3P26045 913 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 EPHB2P29323 1055 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CRHR1P34998 444 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GP5P40197 560 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 LIG3P49916 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SLC5A3P53794 718 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 UGP2Q16851 508 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GALNTL6Q49A17 601 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TEX44Q53QW1 395 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GRTP1Q5TC63 336 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CES5AQ6NT32 575 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ABI1Q8IZP0 508 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ZNF567Q8N184 647 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 NUP93Q8N1F7 819 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PPM1NQ8N819 430 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CCNYQ8ND76 341 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GDAP1Q8TB36 358 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 POF1BQ8WVV4 589 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 STON2Q8WXE9 905 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CFAP36Q96G28 342 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SPATA17Q96L03 361 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 C7orf26Q96N11 449 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CASS4Q9NQ75 786 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SAR1AQ9NR31 198 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 IL37Q9NZH6 218 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 LZTS1Q9Y250 596 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PLLPQ9Y342 182 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.36□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 ZNF292O60281 2723 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TNFRSF10BO14763 440 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TIMM44O43615 452 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SPAG7O75391 227 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 BANF1O75531 89 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 POMCP01189 267 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 APOA4P06727 396 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CCNB1P14635 433 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PSMB4P28070 264 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 FOXN2P32314 431 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SERPINB4P48594 390 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 HK2P52789 917 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 NDST2P52849 883 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 PRKAA2P54646 552 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GEMP55040 296 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 GAD2Q05329 585 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 RING1Q06587 406 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TNK2Q07912 1038 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CDH17Q12864 832 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 BNIP1Q12981 228 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 RIPK1Q13546 671 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 LAMB3Q13751 1172 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 CRYMQ14894 314 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SLC1A5Q15758 541 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TBCCQ15814 346 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 SLC14A2Q15849 920 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 AFMIDQ63HM1 303 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 KCTD11Q693B1 232 aa7.35□□□□□ -1.23
CASC19-232ENST00000641480 BRICD5Q6PL45 260 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms