RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637791.1

MECP2-223, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 5

Gene MECP2, Length 101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-223	ENST00000637791	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CASP10	Q92851	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	STMN2	Q93045	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TCF12	Q99081	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RBBP8	Q99708	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GMIP	Q9P107	970 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791		A0A096LPK6	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791		A0A1B0GVM2	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SOBP	A7XYQ1	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791		H0Y626	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GYG2	O15488	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CACNG3	O60359	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MAFK	O60675	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	DNAJC6	O75061	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SMIM24	O75264	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PMPCB	O75439	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	BANF1	O75531	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	UPP2	O95045	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	UNC5C	O95185	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CLTB	P09497	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CCL5	P13501	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RAG1	P15918	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CCND1	P24385	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GCA	P28676	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PTPN4	P29074	926 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CDC25C	P30307	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	OR1D2	P34982	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CA8	P35219	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NNMT	P40261	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SLC1A6	P48664	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	EPHB1	P54762	984 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	WNT3A	P56704	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	DUSP4	Q13115	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SERINC3	Q13530	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RIPK1	Q13546	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GRM3	Q14832	879 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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