RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620631.4

GTF2I-217, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 868 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-217ENST00000620631 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 GTF2H3Q13889 308 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 IL17AQ16552 155 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 XKR9Q5GH70 373 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 XKR3Q5GH77 459 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RPAINQ86UA6 219 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 NLRP4Q96MN2 994 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 UROC1Q96N76 676 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MAP7D2Q96T17 732 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PLIN2Q99541 437 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SIK2Q9H0K1 926 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PNPOQ9NVS9 261 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PADI3Q9ULW8 664 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 GBF1Q92538 1859 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.06□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 A0A087WZ62 844 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MAGEB2O15479 319 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PROM1O43490 865 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RPS6KA5O75582 802 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 GPC3P51654 580 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MC2RQ01718 297 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 EMC2Q15006 297 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RAB30Q15771 203 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 FAM153CQ494X1 144 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 LONRF3Q496Y0 759 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 EMC10Q5UCC4 262 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 FAM228AQ86W67 206 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PPM1EQ8WY54 764 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ETAA1Q9NY74 926 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MTMR6Q9Y217 621 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CLIC4Q9Y696 253 aa6.05□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 WDR81Q562E7 1941 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 DENND3A2RUS2 1198 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF785A8K8V0 405 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SOAT2O75908 522 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 C1QL1O75973 258 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 GJB5O95377 273 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 FOSL2P15408 326 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PPP3CBP16298 524 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 TMOD1P28289 359 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ABCG1P45844 678 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 NPTX2P47972 431 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 TRAPPC10P48553 1259 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PKP1Q13835 747 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PTPRRQ15256 657 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SPECC1Q5M775 1068 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 C4orf19Q8IY42 314 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 NME8Q8N427 588 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 ERMNQ8TAM6 284 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 NEK9Q8TD19 979 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 SNX21Q969T3 373 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 HAPLN3Q96S86 360 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 YME1L1Q96TA2 773 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF2I-217ENST00000620631 RAD9AQ99638 391 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms