RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT1A9O60656 530 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT34O76011 436 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 VAPBO95292 243 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 C22orf31O95567 290 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKCGP05129 697 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GPIP06744 558 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UMPSP11172 480 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 STMN1P16949 149 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 IL10P22301 178 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIA2P42262 883 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RAP1GAPP47736 663 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIA4P48058 902 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 HMGCS2P54868 508 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC12A2P55011 1212 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH8P55286 799 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 NME5P56597 212 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB10P61026 200 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PSME3P61289 254 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 CXCL9Q07325 125 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 EPS8Q12929 822 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBA3CQ13748 450 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMC2Q13753 1193 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SV2CQ496J9 727 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZBED5Q49AG3 693 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SEZ6Q53EL9 994 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PCID2Q5JVF3 399 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KCTD11Q693B1 232 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TRNP1Q6NT89 227 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PMF1Q6P1K2 205 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BEND5Q7L4P6 421 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PID1Q7Z2X4 250 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR141Q7Z602 305 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPH3Q86UC2 560 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BBS5Q8N3I7 341 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP28Q8NHY6 868 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 FNDC8Q8TC99 324 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GAB3Q8WWW8 586 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 WNT8BQ93098 351 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BORCS5Q969J3 196 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF12Q96FN5 646 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 AGAP3Q96P47 875 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TSGA13Q96PP4 275 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 WRNIP1Q96S55 665 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GID8Q9NWU2 228 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SYBUQ9NX95 663 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 GIN1Q9NXP7 522 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 SEPT3Q9UH03 358 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.84□□□□□ -1.15
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 RRN3P2A6NIE6 340 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 IRF6O14896 467 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 DCLK1O15075 740 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNG3O60359 315 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PIAS1O75925 651 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 BAIAP3O94812 1187 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PGM3O95394 542 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGNO95427 931 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 NPPAP01160 153 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CDK4P11802 303 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP2B6P20813 491 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMB4P28070 264 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRNA5P30532 468 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 SULT1E1P49888 294 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCN5P51795 746 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GEMP55040 296 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 USP46P62068 366 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNA1P78396 465 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBPC1Q00872 1141 aa7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
CAPNS1-202ENST00000586851 GALNT2Q10471 571 aa7.83□□□□□ -1.16
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