RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC39C	Q8N584	583 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD6	Q8NC69	237 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	OR56A3	Q8NH54	315 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CPT1B	Q92523	772 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM162A	Q96A26	154 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SPSB4	Q96A44	273 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPT	Q96BT3	561 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	APOPT1	Q96IL0	206 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SIL1	Q9H173	461 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	COL15A1	P39059	1388 aa		3	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC9	O60706	1549 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGES3L	E9PB15	166 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NDC80	O14777	642 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DNPH1	O43598	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FMO6P	O60774	539 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TULP3	O75386	442 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE8B	O95263	885 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ANXA6	P08133	673 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	UBL4A	P11441	157 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2C9	P11712	490 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DPA1	P20036	260 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MST1	P26927	711 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ACVR2A	P27037	513 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LRPAP1	P30533	357 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PGM1	P36871	562 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CD86	P42081	329 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PAFAH1B1	P43034	410 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GPD2	P43304	727 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE1A	P54750	535 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	EVC	P57679	992 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PPARD	Q03181	441 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP1A4	Q13733	1029 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC29A2	Q14542	456 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TNIP1	Q15025	636 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ASIC2	Q16515	512 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MMEL1	Q495T6	779 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	FAXC	Q5TGI0	409 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	IYD	Q6PHW0	289 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT7	Q86SF2	657 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX18	Q96RF0	628 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGS	Q96S52	555 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	BRF2	Q9HAW0	419 aa		2.99	□□□□□ -1.93
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		2.99	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms