RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FITM2Q8N6M3 262 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF398Q8TD17 642 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C10orf82Q8WW14 230 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF8Q969P0 613 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HMCESQ96FZ2 354 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RBBP8Q99708 897 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.34□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRSQ13332 1948 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TPP1O14773 563 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GLRA3O75311 464 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 UBOX5O94941 541 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HMBSP08397 361 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TPH1P17752 444 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BGNP21810 368 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 OR1D2P34982 312 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA12P43365 314 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RENBPP51606 427 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TNK2Q07912 1038 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MPP3Q13368 585 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf22Q49AR2 442 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PCID2Q5JVF3 399 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FYB2Q5VWT5 728 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 KCNMB4Q86W47 210 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ARMC2Q8NEN0 867 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HERVK_113Q902F9 699 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A51Q9H1U9 297 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 GGT7Q9UJ14 662 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CDH23Q9H251 3354 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BIRC5O15392 142 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NEBLO76041 1014 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TGDSO95455 350 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SOD2P04179 222 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NMBRP28336 390 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MAPKAPK2P49137 400 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 LIMK2P53671 638 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PDE1BQ01064 536 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BNIP1Q12981 228 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DBN1Q16643 649 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RANBP10Q6VN20 620 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TEX26Q8N6G2 289 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 IPMKQ8NFU5 416 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATP2A3Q93084 1043 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TOP1MTQ969P6 601 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 FICDQ9BVA6 458 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 H0YHG0 523 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 J3KR12 359 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD2LO14523 706 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ABLIM3O94929 683 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BPGMP07738 259 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 NEFHP12036 1026 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 TACR2P21452 398 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ALDH3A1P30838 453 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 BMP8BP34820 402 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB103AP81534 67 aa8.32□□□□□ -1.08
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