RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 RENBPP51606 427 aa23.57■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 TAF12Q16514 161 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 HECTD3Q5T447 861 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 DENND1CQ8IV53 801 aa23.57■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 GKN1Q9NS71 199 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2A3Q93084 1043 aa23.56■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.56■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 FITM2Q8N6M3 262 aa23.55■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A51Q9H1U9 297 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 WBP1LQ9NX94 342 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0D9SEW6 157 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf78A6NCI8 922 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 AP3B1O00203 1094 aa23.55■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 TYK2P29597 1187 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.55■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31D3P0C874 917 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RFC2P35250 354 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 SEPT6Q14141 434 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 RANBP10Q6VN20 620 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 DCTN4Q9UJW0 460 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 FSBPO95073 299 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 KLKB1P03952 638 aa23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 TWF1Q12792 350 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 PARP15Q460N3 678 aa23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 KDELC1Q6UW63 502 aa23.54■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.54■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 TPGS2Q68CL5 300 aa23.53■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 WBP2Q969T9 261 aa23.53■■□□□ 1.36
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FAAP20-209ENST00000428120 LTBP2Q14767 1821 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 VAPBO95292 243 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 TIMP1P01033 207 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 MMP2P08253 660 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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