RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAQ8IWI9 3026 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A6NNZ2 444 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF103O00237 685 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OPA1O60313 960 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDH8O95206 1070 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPOP05164 745 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GP1BAP07359 652 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G2AP14555 144 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC9A1P19634 815 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN2P57739 230 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABREP78334 506 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A3Q01959 620 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM259Q4ZIN3 620 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCSK4Q6UW60 755 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSMEM2Q8N112 164 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHC3Q92529 594 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT43Q96FT9 208 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R16AQ96I34 528 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC8Q9BY41 377 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANLNQ9NQW6 1124 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR27Q9NS67 375 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRN3Q9NYV6 651 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL36AQ9UHA7 158 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATMQ13315 3056 aa13.47□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPM6Q9BX84 2022 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0D9SEW6 157 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEMP2A6NFY4 417 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 I6L893 689 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP12O75317 370 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSO75390 466 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DXOO77932 396 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCY5O95622 1261 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX16P57768 344 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APBA1Q02410 837 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSIQ5FYB1 569 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINGO4Q6UY18 593 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBP6Q6ZN66 633 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIC2Q96JB3 615 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPY6RQ99463 290 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP23Q9BVJ7 150 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNKS2Q9H2K2 1166 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDCPQ9H6R7 721 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNCQ9H7C4 482 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP29Q9HBJ7 922 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX10Q9Y5X0 201 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 U3KQA8 63 aa13.46□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK4Q8N1I0 1966 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF462Q96JM2 2506 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7ESM1 405 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAMP1O15126 338 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEFTY1O75610 366 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEBLO76041 1014 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYF5P13349 255 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCR3P49682 368 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SULT1E1P49888 294 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK3P51956 506 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCNP55089 124 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS3P57727 454 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFHR1Q03591 330 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTK2Q05397 1052 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF542PQ5EBM4 170 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BROXQ5VW32 411 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZSR6 202 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF605Q86T29 641 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPP6Q9NZW5 540 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRGXA6NNA5 263 aa13.44□□□□□ -0.26
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms