RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 STAMBPO95630 424 aa20.55■□□□□ 0.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.53■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.52■□□□□ 0.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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