RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARL4AP40617 200 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 INSCQ1MX18 579 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRTP1Q5TC63 336 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT80Q6KB66 452 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDYLQ9Y232 598 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUP205Q92621 2012 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF839A8K0R7 811 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 LMO2P25791 158 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUMBP49757 651 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLK1P53350 603 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 MPP3Q13368 585 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 IKBKEQ14164 716 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 MIPOL1Q8TD10 442 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL1RL2Q9HB29 575 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP3Q9Y6I4 520 aa21.56■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 KPNA7A9QM74 516 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 STAMBPO95630 424 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCAF6Q58WW2 860 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM47BQ8NA70 645 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 LPGAT1Q92604 370 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLCO4A1Q96BD0 722 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP4S1Q9Y587 144 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PSME3P61289 254 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DBN1Q16643 649 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNMB4Q86W47 210 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 OLAHQ9NV23 265 aa21.55■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL18RAPO95256 599 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTBP1Q13363 440 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 POTEHQ6S545 545 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC14AQ86T13 490 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF135Q8IUD6 432 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFB106AQ8N104 65 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF169Q8NCN4 708 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP33Q8TEY7 942 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 XPR1Q9UBH6 696 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRORSD1PA6NEY8 169 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP6AP2O75787 350 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ICAM3P32942 547 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 SULT1E1P49888 294 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBLBQ13191 982 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM110Q86TL2 294 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 39.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.54■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 C9IYK1 514 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DLX3O60479 287 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFV1P49821 464 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 MPP1Q00013 466 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PKDCCQ504Y2 493 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZFP1Q6P2D0 407 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF139Q8WU17 664 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR20Q99678 358 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 SOCS2O14508 198 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 IMPDH2P12268 514 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 MLNP12872 115 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NR2C2P49116 596 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 GJA9P57773 515 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 INCA1Q0VD86 236 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 NXNL1Q96CM4 212 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DRC3Q9H069 523 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 RRN3Q9NYV6 651 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 AKT3Q9Y243 479 aa21.53■■□□□ 1.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.044e-7■■■□□ 14.6
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPL26P61254 145 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms