RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HES2	Q9Y543	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IPP	Q9Y573	584 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	F5	P12259	2224 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339		B5MCH6	92 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339		K7ERI5	159 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TEX28	O15482	410 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STX10	O60499	249 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TSPAN1	O60635	241 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RFPL2	O75678	378 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRKCB	P05771	671 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TH	P07101	528 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RBP3	P10745	1247 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ELF1	P32519	619 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARL2	P36404	184 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SYK	P43405	635 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GPR15	P49685	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLCN4	P51793	760 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CLCN5	P51795	746 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NDUFA8	P51970	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SEC24C	P53992	1094 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARPP19	P56211	112 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CREM	Q03060	361 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TCF15	Q12870	199 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LRMP	Q12912	555 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CAPS	Q13938	189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KCNC3	Q14003	757 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NPY5R	Q15761	445 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MAPK6	Q16659	721 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73	4e-12	■■■■■ 275.7
ATXN3-240	ENST00000556339	MYH11	P35749	1972 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339		A0A1B0GUA9	196 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCL16	O15467	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	B4GALT5	O43286	388 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PI15	O43692	258 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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