RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	BPIFB4	P59827	614 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT83	P78385	493 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	DEUP1	Q05D60	604 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	STAT4	Q14765	748 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TAF3	Q5VWG9	929 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TRNP1	Q6NT89	227 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	IQCH	Q86VS3	1027 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	OXR1	Q8N573	874 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TSC1	Q92574	1164 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ARRDC3	Q96B67	414 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C18orf8	Q96DM3	657 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110		E9PAM4	449 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SDC3	O75056	442 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C1S	P09871	688 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PRLR	P16471	622 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	GLDC	P23378	1020 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	FLT3	P36888	993 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SCNN1A	P37088	669 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	OVGP1	Q12889	678 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	BNIPL	Q7Z465	357 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ERICH1	Q86X53	443 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	OR7D4	Q8NG98	312 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	KLK6	Q92876	244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C1orf74	Q96LT6	269 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	MYOC	Q99972	504 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1W2PQU0	124 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC31A1	O15431	190 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGEC1	O60732	1142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	F9	P00740	461 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	MME	P08473	750 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	JUP	P14923	745 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ARSI	Q5FYB1	569 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	FZD3	Q9NPG1	666 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	APC2	O95996	2303 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ZMPSTE24	O75844	475 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ENDOD1	O94919	500 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PRNP	P04156	253 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	THEGL	P0DJG4	465 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CDK4	P11802	303 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	UCHL3	P15374	230 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1E1	P30953	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	HNF1B	P35680	557 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	CLCN6	P51797	869 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	NOMO3	P69849	1222 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	PROX2	Q3B8N5	592 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	HES3	Q5TGS1	186 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	NEK5	Q6P3R8	708 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG4-208	ENST00000514110	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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