RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474948.5

TTLL3-226, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL3, Length 603 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-226ENST00000474948 SLC35C1Q96A29 364 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ALG14Q96F25 216 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SPATA32Q96LK8 384 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CCDC114Q96M63 670 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 NT5C1BQ96P26 610 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FZD3Q9NPG1 666 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 DYRK4Q9NR20 520 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 VPS28Q9UK41 221 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 U3KQA8 63 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.51□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 COL12A1Q99715 3063 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CPED1A4D0V7 1026 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 A6NNZ2 444 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 H3BM21 787 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PMM2O15305 246 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CLDN11O75508 207 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 TCEA3O75764 348 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 NEBLO76041 1014 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CSF2P04141 144 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PRNPP04156 253 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PRCPP42785 496 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FMO5P49326 533 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CLDN2P57739 230 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 KRT83P78385 493 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CDK17Q00537 523 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CDKN3Q16667 212 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FBXL22Q6P050 247 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 XKR5Q6UX68 686 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 TMEM110Q86TL2 294 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 WDR48Q8TAF3 677 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 BMFQ96LC9 184 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 NOX5Q96PH1 765 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.896e-6■□□□□ 9.5
TTLL3-226ENST00000474948 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HDAC8Q9BY41 377 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FAM117AQ9C073 453 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 THAP9Q9H5L6 903 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RMND1Q9NWS8 449 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 IL17BQ9UHF5 180 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SPTA1P02549 2419 aa9.5□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 TPP1O14773 563 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 AQP9O43315 295 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ZNF202O95125 648 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 MT-CO1P00395 513 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CALCAP01258 141 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CTSLP07711 333 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 SRCP12931 536 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RABIFP47224 123 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 GCNT1Q02742 428 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PKP1Q13835 747 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FZD2Q14332 565 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 NR0B2Q15466 257 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 MEA1Q16626 185 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 RRAGAQ7L523 313 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 CLEC14AQ86T13 490 aa9.49□□□□□ -0.89
TTLL3-226ENST00000474948 PARGQ86W56 976 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms