RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RANBP10Q6VN20 620 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 OTOAQ7RTW8 1153 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PID1Q7Z2X4 250 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC14AQ86T13 490 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF398Q8TD17 642 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 BIRC5O15392 142 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 TGDSO95455 350 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 OLFM2O95897 454 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 PROCP04070 461 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 POLBP06746 335 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 TUBP50607 506 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 NCALDP61601 193 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 CDH17Q12864 832 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 TAF10Q12962 218 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 BNIP1Q12981 228 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP4Q13115 394 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 MTA1Q13330 715 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 SERINC3Q13530 473 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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