RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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HLA-B-250ENST00000434333 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC31Q6UY01 552 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 OR7D4Q8NG98 312 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 HAPLN3Q96S86 360 aa20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 TNFSF14O43557 240 aa20.59■□□□□ 0.89
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HLA-B-250ENST00000434333 ZMPSTE24O75844 475 aa20.58■□□□□ 0.89
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HLA-B-250ENST00000434333 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.58■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.58■□□□□ 0.89
HLA-B-250ENST00000434333 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
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HLA-B-250ENST00000434333 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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HLA-B-250ENST00000434333 PREBQ9HCU5 417 aa20.57■□□□□ 0.88
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HLA-B-250ENST00000434333 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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HLA-B-250ENST00000434333 CCDC114Q96M63 670 aa20.56■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.56■□□□□ 0.88
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HLA-B-250ENST00000434333 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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HLA-B-250ENST00000434333 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 BNIP3Q12983 259 aa20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 SYCP1Q15431 976 aa20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 CDO1Q16878 200 aa20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.55■□□□□ 0.88
HLA-B-250ENST00000434333 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.55■□□□□ 0.88
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