RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC3Q13217 504 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NCAPHQ15003 741 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NAB2Q15742 525 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IMPG1Q17R60 797 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BICRALQ6AI39 1079 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ERAP2Q6P179 960 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 VSTM1Q6UX27 236 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LGI2Q8N0V4 545 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BORCS5Q969J3 196 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 S100PBPQ96BU1 408 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MTMR8Q96EF0 704 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HSFY1Q96LI6 401 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFP42Q96MM3 310 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AP1S3Q96PC3 154 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM129BQ96TA1 746 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP13A1Q9HD20 1204 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IL23AQ9NPF7 189 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX24Q9Y343 169 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 UBR3Q6ZT12 1888 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C4AP0C0L4 1744 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF831Q5JPB2 1677 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3D21A4FU49 640 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM64A6NGJ6 449 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM64BA6NI03 449 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CHP2O43745 196 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN1O60635 241 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ANXA9O76027 345 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARIH2O95376 493 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C22orf31O95567 290 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC130P13994 396 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ALOX12P18054 663 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 OR1E1P30953 314 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PEX5P50542 639 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IST1P53990 364 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP12AP54707 1039 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NCKAP1LP55160 1127 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB2AP61019 212 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 S100A12P80511 92 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RHAGQ02094 409 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GPS1Q13098 491 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAF3Q13114 568 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ITGADQ13349 1161 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TYSND1Q2T9J0 566 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF544Q6NX49 715 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT78Q8N1N4 520 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CPA6Q8N4T0 437 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MYLPFQ96A32 169 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RBBP8Q99708 897 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RAD18Q9NS91 495 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL11Q9NVR0 708 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MYO9BQ13459 2157 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PQJ5 194 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MEI4A8MW99 385 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL16O15467 120 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX28O15482 410 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CST8O60676 142 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NFATC1O95644 943 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C8AP07357 584 aa4.48□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MYBL2P10244 700 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms