RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 ITIH2P19823 946 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ACTN2P35609 894 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 IFNAR2P48551 515 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GAD2Q05329 585 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 IL10RBQ08334 325 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MFSD6LQ8IWD5 586 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TEKT5Q96M29 485 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 NECTIN4Q96NY8 510 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 COL6A3P12111 3177 aa23.75■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 CBX4O00257 560 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MTSS1O43312 755 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 KDELR3O43731 214 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 OPHN1O60890 802 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 FOSL2P15408 326 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 FCHO2Q0JRZ9 810 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 LRRC45Q96CN5 670 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GORASP1Q9BQQ3 440 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ABCB8Q9NUT2 735 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MARK1Q9P0L2 795 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 VPS28Q9UK41 221 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ZMPSTE24O75844 475 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TUBBP07437 444 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PSMB4P28070 264 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ETFBP38117 255 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 OXCT1P55809 520 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 CALCOCO2Q13137 446 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD7Q92527 254 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 HPS4Q9NQG7 708 aa23.74■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.391e-5■■■■□ 22.7
CNN3-202ENST00000394202 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 HLA-DQB2P05538 268 aa23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ARF5P84085 180 aa23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 LINGO4Q6UY18 593 aa23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.73■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 CD160O95971 181 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MCM3P25205 808 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 BRD3Q15059 726 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GPR153Q6NV75 609 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 C12orf40Q86WS4 652 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 FATE1Q969F0 183 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 CCDC151A5D8V7 595 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GOLGA8MH3BSY2 632 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MBTPS2O43462 519 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TMEM63AO94886 807 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ADH5P11766 374 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 NFKB1P19838 968 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GAB4Q2WGN9 574 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MARC1Q5VT66 337 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PGBD5Q8N414 524 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TEX26Q8N6G2 289 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TTC8Q8TAM2 541 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 VAT1Q99536 393 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 VPS51Q9UID3 782 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.72■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MUSKO15146 869 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MT-CO1P00395 513 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PSMC3P17980 439 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MESP2Q0VG99 397 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 KCNJ11Q14654 390 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ECT2Q9H8V3 914 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 NT5MQ9NPB1 228 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 GJB3O75712 270 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 APRTP07741 180 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 RENBPP51606 427 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 MAXP61244 160 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PARP6Q2NL67 630 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 ATP2A3Q93084 1043 aa23.71■■□□□ 1.39
CNN3-202ENST00000394202 E2F7Q96AV8 911 aa23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms