RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpne7Q0VE82 557 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brms1lQ3U1T3 323 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plin5Q8BVZ1 463 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc66Q8K0B3 872 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppa2Q91VM9 330 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 StambpQ9CQ26 424 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr6Q9EPW9 795 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ror2Q9Z138 944 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm15155B1B034 138 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r27D3YUK6 857 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim30bE9PVL6 203 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EsrraO08580 422 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chil3O35744 398 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dsg3O35902 993 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CrymO54983 313 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrna4O70174 629 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 UtyP79457 1212 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P3h1Q3V1T4 739 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdha6Q91Y14 946 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akr1c12Q9JLI0 323 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CasrQ9QY96 1079 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1023A2ASU6 311 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4931406B18RikA2RSL7 367 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9330159F19RikD3Z623 648 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galnt4O08832 578 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CidebO70303 219 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prl3b1P09586 222 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sbk3P0C5K0 361 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pax3P24610 479 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gdf7P43029 461 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SykP48025 629 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PgfP49764 158 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt6aP50446 553 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CstaP56567 97 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh9P70407 786 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ampd1Q3V1D3 745 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Afap1l2Q5DTU0 825 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MyorgQ69ZQ1 716 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inppl1Q6P549 1257 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ip6k1Q6PD10 433 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc17a6Q8BLE7 582 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Necab2Q91ZP9 389 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mat2bQ99LB6 334 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr711Q9EPG2 314 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oxct2bQ9ESL0 520 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oxct2aQ9JJN4 520 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scamp5Q9JKD3 235 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo17Q9QZM8 286 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Shcbp1Q9Z179 668 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf536Q8K083 1302 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700001O22RikA2APZ1 375 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3002E9PW72 216 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prf1P10820 554 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scd1P13516 355 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Matn1P51942 500 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nxpe4Q52KP5 543 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Proser1Q5PRE5 913 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mfsd3Q5U419 412 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rasa4Q6PFQ7 802 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ric8bQ80XE1 520 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slco2b1Q8BXB6 683 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ano4Q8C5H1 955 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rabep2Q91WG2 554 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sult5a1Q91X36 291 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cab39lQ9DB16 337 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PignQ9R1S3 931 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col5a3Q9JLI2 1739 aa21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smok3cA0A087WSF2 504 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930469K13RikA0A286YDB2 92 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt28A6BLY7 462 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akain1G3UWD5 69 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psma3O70435 255 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HmgcrQ01237 887 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Heatr9Q5QNV8 569 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo1gQ5SUA5 1024 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PapolaQ61183 739 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpa1Q8BLA8 1125 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kirrel3Q8BR86 778 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx30Q8CE50 437 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lin7aQ8JZS0 233 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LipmQ8K2A6 422 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhojQ9ER71 214 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap4b1Q9WV76 738 aa21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ern2Q9Z2E3 911 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms