Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR86

Kirrel3, Kin of IRRE-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kirrel3Q8BR86 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Kirrel3Q8BR86 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Kirrel3Q8BR86 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Kirrel3Q8BR86 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Kirrel3Q8BR86 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Kirrel3Q8BR86 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Kirrel3Q8BR86 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,39■■■□□ 2,62
Kirrel3Q8BR86 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Kirrel3Q8BR86 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Kirrel3Q8BR86 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Kirrel3Q8BR86 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Kirrel3Q8BR86 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Kirrel3Q8BR86 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Kirrel3Q8BR86 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Kirrel3Q8BR86 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Kirrel3Q8BR86 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Kirrel3Q8BR86 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Kirrel3Q8BR86 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Kirrel3Q8BR86 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Kirrel3Q8BR86 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Kirrel3Q8BR86 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Kirrel3Q8BR86 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Kirrel3Q8BR86 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Kirrel3Q8BR86 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Kirrel3Q8BR86 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Kirrel3Q8BR86 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Kirrel3Q8BR86 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Kirrel3Q8BR86 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Kirrel3Q8BR86 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Kirrel3Q8BR86 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Kirrel3Q8BR86 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Kirrel3Q8BR86 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Kirrel3Q8BR86 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Kirrel3Q8BR86 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Kirrel3Q8BR86 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Kirrel3Q8BR86 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Kirrel3Q8BR86 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Kirrel3Q8BR86 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Kirrel3Q8BR86 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Kirrel3Q8BR86 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Kirrel3Q8BR86 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Kirrel3Q8BR86 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Kirrel3Q8BR86 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Kirrel3Q8BR86 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Kirrel3Q8BR86 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Kirrel3Q8BR86 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Kirrel3Q8BR86 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Kirrel3Q8BR86 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Kirrel3Q8BR86 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Kirrel3Q8BR86 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Kirrel3Q8BR86 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Kirrel3Q8BR86 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Kirrel3Q8BR86 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Kirrel3Q8BR86 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Kirrel3Q8BR86 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Kirrel3Q8BR86 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Kirrel3Q8BR86 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Kirrel3Q8BR86 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Kirrel3Q8BR86 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Kirrel3Q8BR86 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Kirrel3Q8BR86 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Kirrel3Q8BR86 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Kirrel3Q8BR86 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Kirrel3Q8BR86 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Kirrel3Q8BR86 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Kirrel3Q8BR86 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Kirrel3Q8BR86 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Kirrel3Q8BR86 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Kirrel3Q8BR86 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Kirrel3Q8BR86 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Kirrel3Q8BR86 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Kirrel3Q8BR86 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Kirrel3Q8BR86 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Kirrel3Q8BR86 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Kirrel3Q8BR86 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Kirrel3Q8BR86 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Kirrel3Q8BR86 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Kirrel3Q8BR86 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Kirrel3Q8BR86 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Kirrel3Q8BR86 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Kirrel3Q8BR86 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Kirrel3Q8BR86 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Kirrel3Q8BR86 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Kirrel3Q8BR86 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kirrel3Q8BR86 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Kirrel3Q8BR86 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Kirrel3Q8BR86 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Kirrel3Q8BR86 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Kirrel3Q8BR86 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Kirrel3Q8BR86 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Kirrel3Q8BR86 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Kirrel3Q8BR86 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kirrel3Q8BR86 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Kirrel3Q8BR86 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Kirrel3Q8BR86 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Kirrel3Q8BR86 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Kirrel3Q8BR86 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,92
Kirrel3Q8BR86 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Kirrel3Q8BR86 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Kirrel3Q8BR86 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,1 ms