RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 ASB16Q96NS5 453 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 H0Y626 953 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PAPLNO95428 1278 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ETFBP38117 255 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 NAT16Q8N8M0 369 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SNF8Q96H20 258 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 POMKQ9H5K3 350 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.49■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 E2F8A0AVK6 867 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA6CA6NDK9 693 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GJB3O75712 270 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CPP00450 1065 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ALS2CLQ60I27 953 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 OTOP3Q7RTS5 596 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PID1Q7Z2X4 250 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CNTD1Q8N815 330 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TTC8Q8TAM2 541 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 MYLIPQ8WY64 445 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CPT1BQ92523 772 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ETNK1Q9HBU6 452 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 UBP1Q9NZI7 540 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.48■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GVM2 712 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 HACD1B0YJ81 288 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 OPA1O60313 960 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 BANF1O75531 89 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 MX2P20592 715 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GNA12Q03113 381 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 IL31Q6EBC2 164 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 LZTR1Q8N653 840 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ART4Q93070 314 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CAVIN3Q969G5 261 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RTP4Q96DX8 246 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SNAP91O60641 907 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CLDN11O75508 207 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PEX11BO96011 259 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RHOCP08134 193 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 NDST2P52849 883 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TNK2Q07912 1038 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ANO4Q32M45 955 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 FYB2Q5VWT5 728 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 LINGO4Q6UY18 593 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 LMCD1Q9NZU5 365 aa18.47■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GCATO75600 419 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM63AO94886 807 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CCNB1P14635 433 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PFKLP17858 780 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 PSMB4P28070 264 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 WEE1P30291 646 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GRIA1P42261 906 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 MAXP61244 160 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 USP4Q13107 963 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SERINC3Q13530 473 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SPARCL1Q14515 664 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CES5AQ6NT32 575 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 RHBDF2Q6PJF5 856 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC25Q86WR0 208 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 APCDD1Q8J025 514 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 SMARCD2Q92925 531 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 MUC3BQ9H195 1237 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 A0A0A0MRY4 1105 aa18.46■□□□□ 0.55
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PPC1 479 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms