RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	KAT2A	Q92830	837 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FRG2B	Q96QU4	278 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	UPB1	Q9UBR1	384 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HSF4	Q9ULV5	492 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TBX20	Q9UMR3	447 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CXorf65	A6NEN9	183 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175		A6NLC8	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SYN3	O14994	580 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ANP32C	O43423	234 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NEURL1	O76050	574 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HLA-DQA2	P01906	255 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GSTM2	P28161	218 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CD38	P28907	300 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HNF1B	P35680	557 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GHRHR	Q02643	423 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MAPK7	Q13164	816 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	COLEC12	Q5KU26	742 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NAA35	Q5VZE5	725 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	DDB2	Q92466	427 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FUZ	Q9BT04	418 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175		A0A0G2JK05	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175		F8W810	466 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175		J3KRW8	73 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TLR2	O60603	784 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TULP3	O75386	442 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	LCK	P06239	509 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	WEE2	P0C1S8	567 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	XBP1	P17861	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGAP25	P42331	645 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GPD2	P43304	727 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NR1H2	P55055	460 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	STIM1	Q13586	685 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PKP1	Q13835	747 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	IL13RA2	Q14627	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	BAK1	Q16611	211 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MIDN	Q504T8	468 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ISM2	Q6H9L7	571 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TSPYL6	Q8N831	410 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SCAI	Q8N9R8	606 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SETD9	Q8NE22	299 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	STAM	Q92783	540 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	COQ8B	Q96D53	544 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HVCN1	Q96D96	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ELP4	Q96EB1	424 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MROH8	Q9H579	483 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ACAD9	Q9H845	621 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87

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