RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 A0A087WV48 116 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RFPL3O75679 317 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GNA15P30679 374 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CNTN1Q12860 1018 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PDCLQ13371 301 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PASD1Q8IV76 773 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TSC1Q92574 1164 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SKA1Q96BD8 255 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CPXM1Q96SM3 734 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 DDIT4Q9NX09 232 aa14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 A0A1B0GVM2 712 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RNF103O00237 685 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SDC3O75056 442 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 JUPP14923 745 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SLC9A1P19634 815 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PLK1P53350 603 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SEMG2Q02383 582 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ACCSLQ4AC99 568 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 HES3Q5TGS1 186 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 AGBL4Q5VU57 503 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 Q6ZVU0 165 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 C14orf80Q86SX3 495 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 KLK6Q92876 244 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RNF34Q969K3 372 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SPAG5Q96R06 1193 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.72□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FAM170AA1A519 330 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BICDL2A1A5D9 508 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MED7O43513 233 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 BNIP3LO60238 219 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 NNMTP40261 264 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 USP8P40818 1118 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TAS2R38P59533 333 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 CDK17Q00537 523 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SLC12A1Q13621 1099 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 DLG2Q15700 870 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MEA1Q16626 185 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MED15Q96RN5 788 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 MYOCQ99972 504 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 SNX10Q9Y5X0 201 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 KNTC1P50748 2209 aa14.71□□□□□ -0.05
CTU2-203ENST00000562011 I6L893 689 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 ATP9BO43861 1147 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 CNTN5O94779 1100 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 MT-CO1P00395 513 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 PRB1P04280 392 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 ERBB2P04626 1255 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 CTSLP07711 333 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 CCR1P32246 355 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 PPP1R2P41236 205 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 RXRGP48443 463 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 SULT2A1Q06520 285 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 PAK1Q13153 545 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 NME3Q13232 169 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 SIK2Q9H0K1 926 aa14.7□□□□□ -0.06
CTU2-203ENST00000562011 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms