RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023580.6

Usp25-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp25, Length 4,412 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gpsm1Q6IR34 673 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Sval3Q76I99 144 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Ldoc1Q7TPY9 151 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Fbxl4Q8BH70 621 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Mettl3Q8C3P7 580 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Vps37aQ8CHS8 397 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Basp1Q91XV3 226 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cts3Q91ZD5 332 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gtpbp3Q923K4 492 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Slxl1Q9D515 155 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cnot8Q9D8X5 292 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Trpc2Q9R244 1172 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Bfsp1A2AMT1 669 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cylc2B1AWN8 422 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cbfa2t3O54972 620 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 RhoP15409 348 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gad1P48318 593 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 HpdP49429 393 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Usp46P62069 366 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gbp8Q2V6D6 525 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Odr4Q4PJX1 447 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Grhl3Q5FWH3 603 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Zkscan4Q5SZT6 480 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 EregQ61521 162 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Lats2Q7TSJ6 1042 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Mettl21cQ8BLU2 248 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Slfn5Q8CBA2 884 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cacnb2Q8CC27 655 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Pop1Q8K205 1045 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Mrpl38Q8K2M0 380 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Oas1dQ8VI95 361 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rnf112Q96DY5 654 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Slc39a3Q99K24 317 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rwdd4Q9CPR1 188 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Tubb4aQ9D6F9 444 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Hcar2Q9EP66 360 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Sv2aQ9JIS5 742 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 NumbQ9QZS3 653 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cdc7Q9Z0H0 564 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Diaph3Q9Z207 1171 aa5.64□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rtl9Q32KG4 1339 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gm3642K7N6V4 267 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Akap1O08715 857 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Polr2fP61219 127 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Vps45P97390 570 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Runx2Q08775 607 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Brms1lQ3U1T3 323 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Tbc1d12Q6A039 696 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Mical2Q8BML1 960 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Tmem259Q8CIV2 574 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Fbxo21Q8VDH1 627 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Erlin1Q91X78 346 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Fads1Q920L1 447 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gdap2Q9DBL2 498 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Plod1Q9R0E2 728 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Pde4dipQ80YT7 2224 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 4932429P05RikA2ADI4 785 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Ptar1E9QAB6 424 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Coro1aO89053 461 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Atxn10P28658 475 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Adrb1P34971 466 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 GssP51855 474 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rad54lP70270 747 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Pstpip1P97814 415 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Mtf2Q02395 593 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Zmym1Q3TJB1 983 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Uri1Q3TLD5 531 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Sarm1Q6PDS3 724 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Kcnk12Q76M80 430 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Arl14epQ8BIX3 276 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Acbd3Q8BMP6 525 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Tgif2Q8C0Y1 237 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Usp27Q8CEG8 438 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Acsl5Q8JZR0 683 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Rasgef1cQ9D300 466 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Capn15Q9JLG8 1095 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Arhgef37A1IGU4 676 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Bcat2O35855 393 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Slc22a2O70577 553 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Gm5571P01639 130 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cd40lgP27548 260 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Akt1P31750 480 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 TktP40142 623 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 Cdo1P60334 200 aa5.63□□□□□ -1.51
Usp25-201ENSMUST00000023580 TankP70347 448 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.3 ms