RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ABL1	P00519	1130 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CSF2	P04141	144 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA6	P08133	673 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CREB1	P16220	341 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MSX1	P28360	303 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CIITA	P33076	1130 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MAN1A1	P33908	653 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SCNN1A	P37088	669 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CA7	P43166	264 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	THOP1	P52888	689 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MFAP3	P55082	362 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FBLN7	Q53RD9	439 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ARSH	Q5FYA8	562 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ARL10	Q8N8L6	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440		Q96MF0	132 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	TCHP	Q9BT92	498 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	BARHL2	Q9NY43	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	LRFN1	Q9P244	771 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	HERC2	O95714	4834 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	VWF	P04275	2813 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0U1RQS6	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	STK17B	O94768	372 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ATE1	O95260	518 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PEPD	P12955	493 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	IGFBP2	P18065	325 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP14	P31944	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG1	Q07617	926 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	XKR4	Q5GH76	650 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	KY	Q8NBH2	561 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	RTP4	Q96DX8	246 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRY4	Q9C004	299 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PLK2	Q9NYY3	685 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	C5AR2	Q9P296	337 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC16A	O15027	2179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440		A6NL46	340 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	GAS7	O60861	476 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CTAG2	O75638	210 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	RECK	O95980	971 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CALM1	P0DP23	149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CALM2	P0DP24	149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CALM3	P0DP25	149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	IRF1	P10914	325 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNE1	P15382	129 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	JUND	P17535	347 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	NT5C2	P49902	561 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CASP6	P55212	293 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	ALX1	Q15699	326 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CST6	Q15828	149 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	CUZD1	Q86UP6	607 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	PARG	Q86W56	976 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNAP23-223	ENST00000627440	P3H2	Q8IVL5	708 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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