RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1BP01584 269 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 APOEP02649 317 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DRD3P35462 400 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 BEND5Q7L4P6 421 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 IGSF10Q6WRI0 2623 aa26.48■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR4O00206 839 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN9O14815 690 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 P4HA2O15460 535 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 YKT6O15498 198 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV3-25P01717 112 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 JUPP14923 745 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CETN1Q12798 172 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPE2Q96DL1 559 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 BTN2A3PQ96KV6 586 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC4A5Q9BY07 1137 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CNTN6Q9UQ52 1028 aa26.47■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 LATO43561 262 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFRAP16234 1089 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ACADSBP45954 432 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 BNIP3Q12983 259 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 STIM1Q13586 685 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TTI2Q6NXR4 508 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 EHBP1Q8NDI1 1231 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 FRS2Q8WU20 508 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TSC1Q92574 1164 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM131CQ96AQ9 280 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 POPDC2Q9HBU9 364 aa26.46■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3EA0A087X179 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3LB9A6J9 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 E5RJQ4 531 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 F5H5T6 163 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3HP0C7X1 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HNF1BP35680 557 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCG1P45844 678 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf118Q5T5N4 469 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 HES3Q5TGS1 186 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SFMBT2Q5VUG0 894 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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CAPNS1-211ENST00000590874 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 STK32AQ8WU08 396 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM62Q9BVG3 475 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 URB1O60287 2271 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN2O75298 545 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 C1SP09871 688 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT5P13647 590 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 RXRGP48443 463 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NUCB2P80303 420 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF5Q15542 800 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL19Q6PCT2 694 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG5Q96R06 1193 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SARDHQ9UL12 918 aa26.44■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNU1A8MYU2 1149 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK4P11802 303 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPKBP27987 946 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 NNMTP40261 264 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A1Q13621 1099 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM110Q86TL2 294 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD2AQ8NA29 543 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 ACP6Q9NPH0 428 aa26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 PLK1P53350 603 aa26.42■■□□□ 1.82
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMG2Q02383 582 aa26.42■■□□□ 1.82
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