RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINB3P29508 390 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 AXLP30530 894 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HSPA4P34932 840 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BMPR1AP36894 532 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MAN2A2P49641 1150 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NPEPPSP55786 919 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ACTR2P61160 394 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 COL10A1Q03692 680 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RAB39AQ14964 217 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 EPC2Q52LR7 807 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM31Q5JXX7 168 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PDXDC1Q6P996 788 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC43Q8N309 656 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SVIPQ8NHG7 77 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35A4Q96G79 324 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NEU1Q99519 415 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TCF25Q9BQ70 676 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RAB34Q9BZG1 259 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF302Q9NR11 478 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MAN1C1Q9NR34 630 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PNPOQ9NVS9 261 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 COL20A1Q9P218 1284 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 STK36Q9NRP7 1315 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TTC3P53804 2025 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MYO9BQ13459 2157 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 H3BUI4 141 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RPS6KA5O75582 802 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MATN4O95460 622 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MYL1P05976 194 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CD1AP06126 327 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RAP2AP10114 183 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CTNNB1P35222 781 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SNAP25P60880 206 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ITIH3Q06033 890 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 POU5F1BQ06416 359 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MGAT3Q09327 533 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GPM6BQ13491 265 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM29Q14134 588 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TFDP1Q14186 410 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 Q4G0T1 1027 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 XKR3Q5GH77 459 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RNF220Q5VTB9 566 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CES5AQ6NT32 575 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RNF169Q8NCN4 708 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IL31RAQ8NI17 732 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PMM1Q92871 262 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM122AQ96E09 287 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RGS18Q9NS28 235 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.63□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SCN5AQ14524 2016 aa4.62□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PIEZO1Q92508 2521 aa4.62□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.62□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CAPN8A6NHC0 703 aa4.62□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM227AF5H4B4 570 aa4.62□□□□□ -1.67
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