RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 SPARTQ8N0X7 666 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TMC2Q8TDI7 906 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CIB1Q99828 191 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CALN1Q9BXU9 219 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CLPBQ9H078 707 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPCSQ9HAB8 311 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 OLAHQ9NV23 265 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.67□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MEI4A8MW99 385 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SNAP91O60641 907 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GABBR2O75899 941 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TNNI1P19237 187 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 COMTP21964 271 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GARTP22102 1010 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 WNT7BP56706 349 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 B2MP61769 119 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP8P85298 464 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 STILQ15468 1287 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NPTX1Q15818 432 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 INSCQ1MX18 579 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CARM1Q86X55 608 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SLC29A1Q99808 456 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 STK39Q9UEW8 545 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 E5RJQ4 531 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8RI6L899 631 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 KLF11O14901 512 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NUAK1O60285 661 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 KCNJ13O60928 360 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GMNNO75496 209 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 DDHD2O94830 711 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GZMAP12544 262 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TGM1P22735 817 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MAGEA4P43358 317 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ESRRGP62508 458 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TAS2R42Q7RTR8 314 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GLRX5Q86SX6 157 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GPC2Q8N158 579 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 NLRP7Q8WX94 980 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF516Q92618 1163 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CD101Q93033 1021 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PGBD4Q96DM1 585 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RUBCNLQ9H714 662 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 DSEQ9UL01 958 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.66□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 H0YJX3 145 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ACOX3O15254 700 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TSPAN9O75954 239 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 SERPINA6P08185 405 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 GLRA2P23416 452 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TCEAL1Q15170 157 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC142Q17RM4 750 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 BANPQ8N9N5 519 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CHST13Q8NET6 341 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 DNERQ8NFT8 737 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ACDQ96AP0 544 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RMDN1Q96DB5 314 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 YME1L1Q96TA2 773 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 RMND5AQ9H871 391 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 HMGXB4Q9UGU5 601 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PCM1Q15154 2024 aa8.65□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.65□□□□□ -1.02
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