RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493854.5

RABGAP1-212, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGAP1, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-212ENST00000493854 OR7D4Q8NG98 312 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 METTL6Q8TCB7 284 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 MAP6Q96JE9 813 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 TMEM140Q9NV12 185 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 TBX21Q9UL17 535 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGAP1-212ENST00000493854 ASTN1O14525 1302 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ZMYM6O95789 1325 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TET1Q8NFU7 2136 aa6.4□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TRANK1O15050 2925 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 H3BS24 57 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 RAB27BO00194 218 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF213O14771 459 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TSPAN4O14817 238 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CTAGE5O15320 804 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PRAMEF4O60810 478 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SRGAP2O75044 1071 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 LY86O95711 162 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CD1AP06126 327 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PDHBP11177 359 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CALML3P27482 149 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SLC5A2P31639 672 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 KRT2P35908 639 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PEX19P40855 299 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CD86P42081 329 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CDK7P50613 346 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PPP5CP53041 499 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 EVCP57679 992 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 NOMO3P69849 1222 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 EGR3Q06889 387 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CD69Q07108 199 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MTM1Q13496 603 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ADIPOQQ15848 244 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 DGKDQ16760 1214 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 BTBD16Q32M84 506 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 NLRP14Q86W24 1093 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SPC24Q8NBT2 197 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SCFD2Q8WU76 684 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ZNF480Q8WV37 535 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ESR2Q92731 530 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 STAMQ92783 540 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 ACDQ96AP0 544 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FNBP1Q96RU3 617 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 OR10A5Q9H207 317 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PDE7BQ9NP56 450 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 NEDD4P46934 1319 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 LAMA4Q16363 1823 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MYO7AQ13402 2215 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 MUC3AQ02505 3323 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 A8MXE2 369 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 HIP1O00291 1037 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 SGSM2O43147 1006 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CABYRO75952 493 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CPA1P15085 419 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 CSF2RAP15509 400 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGAP1-212ENST00000493854 TPH1P17752 444 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms