RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 DTX3LQ8TDB6 740 aa13.17□□□□□ -0.3
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PRAME-213ENST00000492657 MFSD3Q96ES6 412 aa13.15□□□□□ -0.3
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PRAME-213ENST00000492657 C7orf26Q96N11 449 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZIC5Q96T25 663 aa13.15□□□□□ -0.3
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PRAME-213ENST00000492657 EBF4Q9BQW3 602 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 15.7
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PRAME-213ENST00000492657 CXCR3P49682 368 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PGGT1BP53609 377 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RSPH3Q86UC2 560 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 FBXO27Q8NI29 283 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 CERS2Q96G23 380 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TMEM216Q9P0N5 145 aa13.15□□□□□ -0.3
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PRAME-213ENST00000492657 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 ZNF778Q96MU6 729 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-213ENST00000492657 VANGL2Q9ULK5 521 aa13.14□□□□□ -0.31
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