RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CAPN15O75808 1086 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 KCNMA1Q12791 1236 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM60Q495X7 471 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CES3Q6UWW8 571 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 VPS33AQ96AX1 596 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A087X1B8 175 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 AGKQ53H12 422 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CDK20Q8IZL9 346 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 DNAJC9Q8WXX5 260 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CASP5P51878 434 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 RTP1P59025 263 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 BBS4Q96RK4 519 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ATP9AO75110 1047 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SEC22BO75396 215 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SERPINE1P05121 402 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ELNP15502 786 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 PAGE2BQ5JRK9 111 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TAGLN3Q9UI15 199 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 RIPK2O43353 540 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MMP3P08254 477 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 DPYSL3Q14195 570 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 EPS8L1Q8TE68 723 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CASZ1Q86V15 1759 aa25.5■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 M0R3G1 203 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GLUD1P00367 558 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC1A6P48664 564 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CATP04040 527 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ALFQ53S48 1182 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 METTL6Q8TCB7 284 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CCT7Q99832 543 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM245Q9H330 911 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 BTBD19C9JJ37 291 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CYP20A1Q6UW02 462 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ASTN1O14525 1302 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM13O60858 407 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 FGF19O95750 216 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MAMLD1Q13495 774 aa25.49■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ITGB5P18084 799 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CD86P42081 329 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CCDC142Q17RM4 750 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MICU2Q8IYU8 434 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ARL15Q9NXU5 204 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 OPTCQ9UBM4 332 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 LAG3P18627 525 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 CDC25CP30307 473 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 PCID2Q5JVF3 399 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 IL22Q9GZX6 179 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 VPS4BO75351 444 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TEX9Q8N6V9 391 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ANKRD7Q92527 254 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 KCNA3P22001 575 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 POU1F1P28069 291 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 RIN3Q8TB24 985 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SPACA7Q96KW9 195 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GUCY1B2O75343 617 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GPR15P49685 360 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 IL2P60568 153 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 KLC1Q07866 573 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 OSBPL10Q9BXB5 764 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.48■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 B4GALT5O43286 388 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 DAB1O75553 588 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GLI1P08151 1106 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 SELPP16109 830 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 GPSM1Q86YR5 675 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ASB2Q96Q27 587 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 TCF7L2Q9NQB0 619 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 DERAQ9Y315 318 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 AMD1P17707 334 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 ATP6V1B2P21281 511 aa25.47■■□□□ 1.67
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM46CQ5VWP2 391 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms