RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 RERGLQ9H628 205 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CDH17Q12864 832 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L15C9J2P7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L11C9JVI0 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L18D6R9N7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L22D6RA61 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 USP17L19D6RCP7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MORF4L1Q9UBU8 362 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 NFICP08651 508 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ERCC2P18074 760 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 KCNJ1P48048 391 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 BTG4Q9NY30 223 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 CHPFQ8IZ52 775 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 FAM129BQ96TA1 746 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DPY30Q9C005 99 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 A0A087X0T9 212 aa8.37□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 SERPIND1P05546 499 aa8.36□□□□□ -1.07
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PKHD1-201ENST00000340994 BSNDQ8WZ55 320 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DSEQ9UL01 958 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 SLIT1O75093 1534 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ITGALP20701 1170 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 PKN1Q16512 942 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 ALFQ53S48 1182 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 CD320Q9NPF0 282 aa8.36□□□□□ -1.07
PKHD1-201ENST00000340994 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.36□□□□□ -1.07
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