RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	MAD1	P40957	749 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	MDG1	P53885	366 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
YHI9	YHR029C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	GAS4	Q08271	471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	SRS2	P12954	1174 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	RGP1	P16664	663 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	IOC3	P43596	787 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	YJR107W	P47145	328 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	NUT2	Q06213	157 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	MNL2	Q12205	849 aa		5	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	QDR1	P40475	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	MTO1	P53070	669 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	FRT1	Q99332	602 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	VAN1	P23642	535 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	TPM2	P40414	161 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	ACF4	P47129	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	NSE3	Q05541	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	TRS33	Q99394	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHI9	YHR029C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
YHI9	YHR029C	UBP1	P25037	809 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	MET4	P32389	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	SUV3	P32580	737 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	GRX4	P32642	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	MSC7	P38694	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	MCM2	P29469	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	SCD5	P34758	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
YHI9	YHR029C	FYV10	P40492	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	RPN4	Q03465	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	PEP7	P32609	515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	GRX7	P38068	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	MNN1	P39106	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	VPS16	Q03308	798 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	OMA1	P36163	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	YJL049W	P47048	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	CWC24	P53769	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	HEH2	Q03281	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	PIN2	Q12057	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	CLN2	P20438	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	KAP122	P32767	1081 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	HXT5	P38695	592 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	BUD6	P41697	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	YJR142W	P47173	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	CWH41	P53008	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	YGL081W	P53156	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	SPR28	Q04921	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	KAR1	P11927	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	ALG14	P38242	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHI9	YHR029C	GAL11	P19659	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	YEN1	P40028	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	PRK1	P40494	810 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	AIM21	P40563	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	IRC24	P40580	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	INP52	P50942	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	SKP1	P52286	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	NHA1	Q99271	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RPB10	P22139	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	APM2	P38700	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	QDR2	P40474	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	BUD9	P53226	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	BDF2	Q07442	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	ISC10	P32645	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	YBR197C	P38306	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	UBP12	P39538	1254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	ERP2	P39704	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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